Pues son más comunes en javascript/DHTML donde los creas y modificas a tu antojo ..
Si necesitas de "dinamismo" a esos menus desde PHP .. sólo es cosa de cargar esas "array's" que usan desde PHP o archivos que manejen con la estructura y gerarquía de menus ..
Ejemplos tienes en:
http://www.dhtmlcentral.com/projects/coolmenus/
Y tienes otras aplicaciones para windows q te perminten crear menus DHTML de forma rápida y con monton de opcines y asistentes ... (usa google y busca por DHTML+menu )
Un saludo,
PD: y si no es eso lo que buscas .. explicate mejor con eso de "administrar menus" y recuerda que PHP se ejecuta en el servidor ..así que no tiene forma de controlar los "menos que puedas mover y accionar en el cliente (navegador)...