por cierto se me olvidaba , puedes ponerte un servidor ftp en tu pc en esta url tienes uno gratuito y que va muy bien
http://www.jgaa.com/, lo instalas le das como document root la carpeta que utilizas como server y con el cliente ftp normal que
utilizas para subir los archivos le puedes dar los permisos chmod
normalmente clicando con el boton derecho del cliente ftp.
Tb tener un servidor ftp es interesante para utilizar las funciones
ftp de php, que son muy interesantes.
un saludo