Para revisar cuentas de correo tienes el protocolo IMAP .. ye en PHP tienes las funciones (si tienes instalada dicha extensión):
www.php.net/imap
Para crear cuentas de e-mail en servidores POP ..ahí se complica el tema con respecto a PHP (por temas de permisos de ejecución ..)
Es más típico ver aplicaciones en Perl que hagan dicho cometido que no en PHP ..
De todas formas habría que ver que tipo de cuentas son las que necesita ese servidor POP3 .. Hay alguos servidores que pueden tener sus usuarios en BD Mysql .. con lo cual sería cosa de hacer un simple "insert" para crear una cuenta .. En otros casos son usuarios del própio sistema (ahí es donde se complica el tema de crear cuentas si lo vas hacer desde PHP .. )
Un saludo,