Como muy bien te han comentado en cain y josemi, yo tambien te voy a decir que al menos en la empresa donde trabajo los costes se calculan en funcion al tiempo de desarrollo, a parte de ello se hace un organigrama con la planificacion del proyecto, ten en cuenta que no se cobra lo mismo por hora de diseño que por hora de programacion, cada gremio tiene sus tarifas etc etc, segun el proyecto aumenta el precio o disminuye, segun en que parte del mundo vivas podras cobrar mas o menos, y aun mas dependiendo del cliente, si es una empresa importante, grande de su sector o no ... por que no le vas a cobrar lo mismo a una empresa como Cocacola y otra como Planchas San Agustin jeje por decir algo, eso tambien influye ... y tambien el presupuesto con el que cuente el cliente, y sobre todo las necesidades, dependiendo de los conceptos que se efectuen cobraras X o X*2 o lo que sea, yo en la mayoria de los proyectos donde trabajo se analizan de la sigueinte manera:
Analisis de contenidos y servicios
Diseño de interface y creacion de plantillas
Desarrollo y programacion web
Desarrollo de diferentes idiomas
Implantacion y hosting en servidor de internet
Esos son normalmente los conceptos que se analizan ... y en funcion de eso se cobra
Espero que t sirva de algo.