En la máquina linux debes configurar soporte ODBC y ahí es donde via tu intranet le diras la ubicación del archivo en tu red (que estará en tu pc windows).
Y a PHP le tienes que instalar las extensiones para que pueda trabajar con las funciones ODBC.
http://www.php.net/odbc
(lee los comentarios de los usuarios y las referencias a los drivers ODBC para linux que se mencionan)
Un saludo,