Sobre "levantar" Msyql .. No sé como habras instalado todo .. Pero te dejo una guía completa de instalación de todo: Apache+PHP+Mysql .. y otras cosas que te pueden interesar.
http://www.maestrosdelweb.com/editorial/phpmysqlap/
Luego, te recomiendo leer algún tutorial de PHP .. Por lo menos para que sepas QUE es .. para que cuando una aplicación te pida X datos para instalarla (ejemplo PHP-Nuke) sepas de que están hablando ...
Sobre la instalación de PHP-Nuke .. sólo te recuerdo que no es más que una aplicación escrita en PHP y que usa Mysql como base de datos ..así que si lees su manual ahí veras los pasos a seguir .. Para todo esto tenemos el foro "Aplicaciones Prefabricadas" que ademas dispone de unas FAQ's para que las leas.
Un saludo,