Si te refieres a esto KillerBKS ...
Código PHP:
$id_cert[]=$row["id_eval"];
Si, es perfectamente válido: se incrementa automáticamente el indice del array a cada petición de esa variable (array) que hagas .. ejemplo .. en interacciones de un bucle (como es tu caso). El indice inicial empieza en 0 ...
Un saludo,