Me parece que te estás liando un poquito. Mira yo lo hago de la siguiente forma:
1) Archivo Nuevo, en la ventana que te sale con el nombre, altura, anchura, resolución etc., activas en contenido la de Trasnsparente y pulsas OK.
2) Escribes el texto que quieras.
3) Te vas a Archivo - Guardar para Web.
4) Cuando le visualices en la ventana debajo de Ajustes: donde están todos los formatos; GiF, Jpg, Png etc. eliges el GIF.
Ten encuenta que debajo de estas ventanitas hay una que pone (Transparencia). Esta casilla la tines que tener activada ya que si no por mucho GIF que quieras hacer no te lo va a efectuar transparente, verás como con ello chequeado la imagen se vuelve transparente, ya que de lo contrario se verá con fondo aunque el formato sea GIF.
Una vez verificado todo le das a Guardar y listo.
Suerte con esta nueva explicación.
