Bueno yo estaba en el mismo problemas y como ma ayudaron a resolverlo fue de esta forma, con implode:
Código PHP:
//ELIMINAMOS ID DE LA RESPECTIVA TABLA
if(isset($_POST['Borrar']))
{
mysql_select_db("prueba");
$array =implode(',', $_POST['eliminar']);
mysql_query("DELETE FROM ".$_POST['tablas']." WHERE ID IN (".$array.")") or die("MySQL dice: ".mysql_error());
}
?>
donde el nombre del check box seria :
Código PHP:
<input type="checkbox\" name=\"eliminar[]\" value=\"".$row['ID']."\">
bueno asi ya ando eliminando varios registros a la vez..
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Saludos