La versión Javascript y un sólo combo para seleccionar que acción ejecutar (borrar o modificar).
Código PHP:
<form name="formulario" action="" method="">
<?
// Tu código PHP para genear el combo
?>
<input type="submit" name="Submit" value="borrar" onClick="this.form.action.value='borrar.php'">
<input type="submit" name="Submit" value="modificar" onClick="this.form.action.value='modificar.php'">
</form>
La parte javascript .. es probable que no sea correcta (lo escribí al "vuelo" y javascritp no es mi fuerte) en todo caso ese punto te lo pueden confirmar en el foro de Javacript.
La parte javascript (al pulsar el botón uno de los dos ..) lo que hace es cambiar al instante el valor del action del formulario .. haciendole que apunte a uno u otro script de los que ya tendrás para ese proceso.
Un saludo,