Hola,
Supongo que ahora te dira 100 segundos excedidos. Porque si te sigue poniendo 30 segundos es que o no has actualizado el php.ini correcto, o que no has reiniciado el servidor web.
De todas formas, si solo quieres modificar el tiempo de ejecucion para ese script, puedes usar la funcion set_time_limit() (
www.php.net/set_tiem_limit), que incluso te permite especificar sin limite de tiempo.
Saludos.