Es el santo grial buscado en este tema.... el lograr que algo quede por encima de un flash....
Se usa el truco del div con un z-index mayor que el z-index del flash pero creo que sólo sirve en algunos de los últimos navegadores.
También se usa el truco de que el flash tenga fondo transparente....
Mira en las FAQ del foro de flash que hay una que va de eso
