mmmmm...para que instalas el apache 2 ? aun tiene ciertos problemas.
por default esta instalado el apache 1.3 en MacOS en cualqueira de sus versiones. Me parece que los binarios del apache 2 vienen dentro, mas no estan instalados. De hecho...el php ya viene instalado en mac, solo hay que mover un par de lineas en el archivo de configuracion para cargar los modulos...el problema es que es un php bastante light y poco funcional. Actualmente mark linyage (o como se escriba su apellido) tiene en su web de entropy (del que pusiste el link) un package de php que solo se instala con un doble click y listo. Igual en la web de mysql hay otro paquete clickeable para instalar la db (en la pagina de linyage tambien vienen las instrucciones). Creo que te estas complicando mucho la vida al intentar compilar los binarios cuando ya esta montado por default el apache
Acerca del error de permiso, no se si probaste seleccionando el folder (manzana + i) y cambiando los permisos para que sean tambien de lectura
Yo tengo corriendo en mi compu
Apache 1.3.28
PHP 4.3.1
MySQL
Otro foro muy bueno dedicado exclusivamenbte a mac es
www.macosx.com
suerte!