Hola,
Mira en el codigo HTML generado. Si ves que lo campos HIDDEN tienen los valores correctos, bien.
Mejor si usas los arrays superglobales, en este caso el $_GET:
Código PHP:
<?
echo "leyendo las variables = ";
echo "variable\$ED: {$_GET['ED']} <br>\n";
echo "variable\$PMAT8: {$_GET['PMAT8']} <br>\n";
?>
Y aqui se acabo todos los problemas que pueden ser causa de PHP. El resto es problema de javascript (que tiene foro propio).
Aunque ya puestos a comentar, si usas un boton submit, ¿para que usas el onclick? Quizas lo que necesitas es un boton normal. Y en tu funcion javascript optienes el valor de otro campo. Si ese te lo hace bien tal como esta, ¿por que no lo haces igual con los hidden? Son campos igual que los text.
Suerte.
PD: Si compruebas que PHP no tiene la culpa, lo dices para que movamos el mensaje a javascript.