Se puede hacer .. pero, debes genererar tu código javascript completo (supongo que llenado un par de arrays de javascrpt) desde PHP .. Es decir .. hacer tu consulta SQL a tus dos tablas y generar el código Javasscript de esos arrays+la gestion desde Javascript que implica.
Si mal no recuerdo . .en este foro había un ejemplo (pero ahora no lo encuentro).
Lo otro que puedes usar es lo que llaman "remote scripting" que se basa en iframes/frames ocultos y mucho javascript para hacer tus consultas a tus BD sin "recarga" aparente de la página (en realidad algo se recarga .. pero suele ser un iframe/frame oculto ..)
Te dejo info sobre ese tema para que veas:
http://www.ashleyit.com/rs/jsrs/select/php/select.php
Un saludo,