Pues necesitamos ponernos parte de ambos códigos para que le echemos un ojo, sino como vamos a saber que falla??
De entrada lo que haces es totalmente natural, mandar llamar un PHP desde un HTML es muy común y deberías tener algo asi:
HTML
<input type=text name=nombre>
PHP
print " Hola $nombre";
Todo lo que mandas de tu forma html lo puedes manipular en el PHP que mandaste llamar en tu ACTION de la forma.
Será mejor que nos pongas algo de código para ayudarte de una mejor manera...