Hola
Es posible que te falte el codec de video. Puedes averiguar el codec con el programa GSpot y luego instalarlo.
Si eso no funciona, tienes otra posibilidad: con el virtualdubmod puedes descomprimir el video e importarlo así en premiere (pero primero hay que instalar el codec). Como supongo que serán videos cortos, no deberían ocupar demasiado descomprimidos (varias decenas de MB seguro que si, pero no deberias tener problemas con premiere).
He visto muchas camaras digitales que usan el codec MJPG, te dejo un link de descarga por si es el que tu necesitas (compruebalo antes con el GSpot)
www.mundodivx.com/stuff/mcjpg30.zip
Un saludo