Perdona la tardanza, pero es que he estado mu ocupado, mira a ver si te sirve:
<html>
<head>
<script>
function cargado(){
var uno = document.getElementById("uno");
var dos = document.getElementById("dos");
dos.style.top = uno.offsetHeight - dos.offsetHeight;
dos.style.left = uno.offsetWidth - dos.offsetWidth;
}
</script>
</head>
<body onload="cargado()">
<div style="width:800px;height:200px;background-color:#ff0000;position:relative;" name="uno" id="uno">
<div style="width:100px;height:50px;background-color:#0000ff;position:relative;" name="dos" id="dos"></div>
</div>
</body>
</html>