style.backgroundColor te permite modificar el color de fondo del atributo style de la etiqueta. O sea que necesitaría algo así :
<a href="" style="background-color:transaparent">
Lo que en realidad intentas hacer es modificar el color de fondo *calculado* por el navegador, fondo que depende de la herencia de los varios estilos. Eso es mucho más difícil. La manera estándar es usar la propiedad getComputedStyle que navegadores recientes como el Opera 7.5 o el Mozilla conocen. El problema es que el abuelo IE6 no lo conoce ypor lo tanto hay que usar una función propietaria de Microsoft que se llama computedStyle.