Si realizas una búsqueda, verás que hay algunos mensajes que tratan el tema,
por ejemplo éste.
Por lo otro, no sé exactamente lo que quieres hacer, pero un stop en un fotograma afecta a la línea de tiempo respectiva. Si quieres que esa línea de tiempo continúe y se detenga un movieclip deberás indicar en ese fotograma la acción:
Código:
nombredelainstancia.stop();