Nesesito ayuda con php y java script

[Ixtleco]

Bueno amigos tengo un prblema y espero que me puedan ayudar.
Bueno tengo un contador hecho con php, el contador cuando llega a la visita numero 1000 pone en la pantalla una felisitacion pero mi problema es que quiero que le mande un mensaje de alerta dando la felisitacion.
Se que para mandar el mensaje es con este codigo
<script>
window.alert(Felisidades tu eres nuestro milesimo usuario.)
<script>
pero al tratar de ponerlo junto con el if de php me muestra un error
les agradeseria que me ayudaran