Pero .. esa classe que usas permite añadir datos o sólo crear desde cero el .xls? .. tiene métodos para leer un .xls (directo) o sólo para escribir? .. si es así tendrás que buscarte otra classe que "lea" el .xls como para que uses tu actual classe y sepas donde termina el último dato para seguir añadiento a tal columna ...
(insisto que no he usado esa classe en concreto .. así que espera que alguien que la use te dé algún consejo o bien otras alternativas como podría ser usar COM (si usas windows en tu servidor) ..
www.php.net/com)
Un saludo,