Hola
Si el archivo es un AVI, OGM o MKV, mejor que Virtualdub recomendaría Virtualdubmod, que es como el Virtualdub pero soporta muchos más formatos (includio MP3 VBR, pero también OGG, AC3, DivX WMA, duales...). Y para archivos MPG recomendaría TMPGEnc.
Un saludo