Yo te recomendaría usar Apache como servidor HTTP para usalo con PHP (si no vas a usar ASP) (e instalado como módulo de Apache) en lugar de IIS (tendrías primero que desactivar el servicio de IIS en tu W2K3):
http://www.maestrosdelweb.com/editorial/phpmysqlap/
Si quieres instalar PHP sobre IIS .. baja el instalador de la sección de descargas de php.net (el "Installer" .. de windows) y sigue las instrucciones que lo acompañan.
www.php.net/download
Para instalar Mysql puedes usar la guía que te dejé el link .. eso es independiente del servidor HTTP que uses en conjunto o no con PHP.
Un saludo,