Hay varias herramientas para la creación de ayudas. Regularmente a partir de estas podes generar archivos de ayuda a diferentes formatos.
.hlp (como si lo hicieras con el help workshop a partir de un .rtf)
.chm (ayuda en formato html... muy mala por cierto)
.html
.pdf, etc.
A mi me gusta el Robo-help, que es de macromedia.
http://www.macromedia.com
Hasta luego.
;)