Hola
al mostrar los registros asigna para cada registro un radio con el mismo nombre con un identificador unico del registro
<input type='radio' name='iden' value=$Registro[id]>
asi cuando selecciones alguno de ellos en la variable iden se guardara el id del seleccionado, luego puedes eliminarlo usando la variable iden el hacer click en un boton.
Espero te ayude
