Si ves en el manual...
http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/LOCK_TABLES.html
Verás que
LOCK TABLES tu_tabla WRITE;
Bloquea la tabla para que sólo tú puedas escribir en ella. Y en este momento haces todos los inserts.
Si te das cuenta la secuencia es... creas tu tabla, la bloqueas para el resto, insertas todos los registros y la desbloqueas.... y así con todas las tablas.
Saludos
