Para ZendEncoder necesitas que el PHP (servidor) que corra tus aplicaciones tenga instalada dicha extensión .. si no la usan .. no podras "encriptar/codificar" tu código ..
Para ponerlo algo más "dificil" .. podrías "ofuscar el código" que no es más que complicar la lectura del código .. pero el código está ahí y es interpretado de igual forma, puedes probar:
POBS
http://pobs.mywalhalla.net/
Un saludo,