Cita: output started at /home/webcoco/public_html/cuisad/header.php:3
Esta parte del mensaje te dice que has generado salida en la linea 3 del fichero header.php y que ha detectado el error en la linea 9 de contador.php. Y tu dices que el codigo que has puesto corresponde a index.php.
No se si te habras liado con los ficheros que incluyes. Repasa que antes de la linea 9 de contador.php no se haya incluido header.php (ya sea en el propio contador.php o en el que incluya a contador.php).
Saludos.