Ese link que pusistes contiene unas variables en el .. con ciertos valores, depende como trates esas variabels y sus valores en el script que los recibe (en ese caso ese tal "newthread.php" algo hará .. No hay una norma fija de que por llevar X variables el URL ha de hacer algo en especial.
El tema de "ligar" "una" PHP con "una" HTML no entendí a que te refieres ... Pero .. ese mismo link que pusistes es HTML y (si lo usas en <a href=" ....">...</a>) y ya está "ligando" a un script PHP (ese newthread.php)
También puedes "incluir" dentro de un script PHP (.php) algo en .html vía la función include() .. Al reves (de un .html incluir un ".php") se complica el tema (pero tiene solución, realmente no es extremadamente común hacer eso).
Un saludo,