Como dice living ..
para el move_uploaded_file() vas a usar los clásicos $_FILES para indicar el archivo que subió a tu servidor que corre tu script PHP ... y luego desde ahí en el mismo proceso pudes usar las funciones de ftp de PHP (
www.php.net/ftp) para conectarte al otro servidor y "subirlo" a este último.
Incluso podrías omitir usar move_uploaded_file() si tomas el archivo originen para las funciones FTP desde: $_FILES['archivo']['tmp_name'] (que esto puedas hacerlo directamente dependerá de los permisos que tengas para tal taréa, pero en su defecto puedes usar move_uploaded_file() y si no necesitas más el archivo en el servidor que corre tu script PHP .. lo borras con unlink() tras haberlo movido hacia el otro servidor vía FTP).
Un saludo,