Cita: Es q mi problema es q no puede ser una carpeta completa, lo que necesito es tomar solo los nombres de una carpeta q seleccione el cliente de su disco
Para eso tendràs que usar algún ActiveX o similar (escrito en lenguaje del "lado del cliente") que le dé permiso al navegador de turno para ese PC concreto hacer eso.
De hecho si usas google un rato y buscas por: multiple upload activeX .. veras un montón de estas utilidades.
La otra alternativa como ya te han comentado es que instales un servidor FTP en ese PC de tu cliente y que sea PHP con sus funciones de FTP (
www.php.net/ftp) el que se conecte a ese servidor (al PC de tu cliente) como "cliente" y haga el proceso automàtico.
Un saludo,