Si no tienes permisos suficientes en tu BD como para hacer una conexión remota a tu BD .. (no locales sólo), para automatizar el proceso .. podrías hacer:
1) Instalar un servidor FTP en ese PC que dispone tu BD local
2) La aplicación que corre en ese servidor local .. tendrá que generar el SQL (INSERT's .. etc) de los datos que requieras.
3) Tu servidor remoto ... se tendría que conectar por FTP a tu servidor local (bajo ese usuario creado) para obtener el archivo (SQL) generado y de ahí .. tu servidor remoto procesaría ese SQL como corresponda.
Otra alternativa es que desde tu servidor remoto acceda al local pero sólo a la BD (a Mysql) .. Si se supone que el sitio remoto sólo va a tomar X datos del "local" y que en ese servidor local puedes configurar los usuarios y permisos de estos como quieras .. que así lo haga en sus consultas SQL ... Todo esto por supuesto requiere de una conexión permanente a internet en ese servidor "local" y si no hay IP fija .. tendrás que usar sevicios de DNS dinámico (tipo
www.ods.org)
Un saludo,