Que yo sepa, no hay ningún proceso automático para realizar lo que necesitas (si alguien lo conoce que lo comparta
).
Yo, cuando necesito varias capas de un PSD, guardo para web desde Photoshop cada una de las capas de forma independiente en formato PNG (me guarda las transparencias) y después monto todos los PNG's en Flash.
Saludos, compañero
