Puedes hacerlo de varias formas:
A. Por GET en una url llamando al script.php que lo recibe con un link
1º Enviamos el array por la url tras imprimirlo en el link
// creamos una funcion que escriba el valor del array en el link
<script>
array_content = new Array();
function write_array() {
document.write(array_content);
}
</script>
// Escribimos el link con el valor del array
<script> document.writeln('<a
href="script.php?array_content='+write_array()+'"> ';</script>
2º script.php recoge el array de Javascript por el metodo GET.
$array = $_GET['array_content'];
B. Por un formulario con metodo POST
1º En un boton oculto metemos el valor del array
<form method="POST" action="script.php">
<input type="hidden" value="meter el valor aqui"
name="array_content">
</form>
2º script.php recoge el array de Javascript por el metodo POST
$array = $_POST['array_content'];
Esto esta sin probar es lo que me contestaron en un grupo esta tarde hare pruebas y os cuento, si probais vosotros ya me direis.
salu2!!