Vamos a ver:
Si quieres hacer una pagina web en html y llamar a una que tiene el codigo en php tienes que primero crearla con la extension *.php pero donde llames a la pagina php tiene que ser algo asi:
<? include 'pagina_php.php'; ?>
Es muy importante que todo codigo php vaya entre <? (para abrir) y ?> (para cerrar).
Ademas despues de cada instruccion debes poner ";".
Despues en la pagina que quieras introducir no debes poner el encabezado ni nada de eso solo el codigo que quieras pues ya lo tiene la pagina principal.
Yo creo que por lo que me has comentado quieres que segun pinche el usuario en una zona u otra aparezca en el centro de la pagina una u otra seccion verdad?
Pues para eso necesitaras un poquito de programacion php pues deberas introducir condiciones.
Mira, mi pagina
http://www.levanteweb.com esta echa asi (con includes). Yo hago una pagina de inicio con una tabla y una imagen arriba y en el centro segun lo que se pinche el usuario se carga una cosa u otra. Mirala bien y veras como es asi. Para ver el codigo vete a Ver-->codigo fuente y veras como lo hago. Puedes hacerte una idea no?