Pueden ser dos cosas:
- Que el formato de audio sea uno de los no soportados por tmpgenc, como AC3 u OGG. En ese caso tienes que hacer un paso previo:
www.mundodivx.com/mpeg/previampg.php
- Que el formato de audio sea MP3 y no tengas bien configurado el tmpgenc. Mira entonces por
www.mundodivx.com/mpeg/tmpgenc.php?p=2
Espero que te sirva