En la documentaciòn y tutoriales de PHP Mailer (
http://phpmailer.sourceforge.net) tienes ejemplos para enviar tu e-mail en formato HTML (e incluso en ambos formatos: texto plano y HTML simultàneamente por si tocas con un cliente de correo que no acepta HTML).
Para aplicar el "formato" a tu e-mail se trata de que lo hagas en HTML y le indiques a PHP Mailer (con sus mètodos y funciones para tal fin) que eso serà para que lo envie en HTML.
Un saludo,