Prueba a poner dentro del tag <td> don pones una tabla : style="vertical-align: top;".
Tedria que quedar algo asi:
Código HTML:
<table>
<tr>
<td style="vertical-align: top;">
<table> .. tabla interna de la izquierda ..</table>
</td>
<td> ... </td>
<td style="vertical-align: top;">
<table> .. tabla interna de la derecha ..</table>
</td>
</tr>
</table>
Espero que te sirva, y un consejo, no uses tablas para maquetar páginas webs
Un saludo
Zerjillo