hola heberto, te paso un párrafo que habla brevemente sobre los formatos de imágenes más usados en la web.
Cita: Los principales formatos de imágenes que se utilizan en Internet son GIF y JPG. El primero para imágenes con pocos colores (hasta 256) y el segundo para fotografías de millones de colores. Los archivos de imagen con extensión GIF son adecuados para introducir gráficos, imágenes pequeñas de navegación u otras imágenes que no incluyan muchos colores... Los archivos GIF pueden tener transparente el color del fondo ... La ventaja de los archivos JPG es que guardan una buena relación calidad-tamaño y se pueden comprimir bastante sin perder aparentemente calidad. Ambos formatos de imagen, además, pueden aparecer paulatinamente en la página web sin necesidad de que el navegador cargue del todo cada imagen antes de ser mostrada; en los archivos GIF, esta característica se llama entrelazado y en los archivos JPG, progresivo.
Extraído de:
http://fresno.cnice.mecd.es/~avaler3/lec02.htm
En cuanto a los problemas con este tipo de archivo, muy sencillo:
Flash no puede mostrarlos con loadMovie !!!
Saludos ;)