En ese caso tenés que cargar el archivo a una variable primero:
Código PHP:
$file = file("archivo.txt");
$filestr = implode("", $file);
mysql_query("SELECT * FROM tabla WHERE fila = '$file' ORDER BY ide DESC");
PD: por como estás usando LIKE, sería lo mismo que uses =. Un comentario nomás =P
Suerte
Fede