Deberías especificar bajo que condiciones ejecutas ese script .. que versión de PHP en que sistema operativo u otros detalles.
Te lo comento por qué según el manual oficial de PHP, dicha función está disponible desde: 4.2.0 o superior ..y aparecen comentarios sobre otras condiciones y versiones de PHP que tener encuenta:
http://www.php.net/mssql_fetch_assoc
Un saludo,