Todo depende de que versión de Mysql uses .. Mysql 4.1 con PHP 5.x se puede usar de forma más óptima con las extensiones mysql
i (
www.php.net/mysqli) pero también peudes usar las "viejas" librerias (y extensiones en consecuencia): mysql (
www.php.net/mysql) .. sólo con el detalle de "migrar" tus usuarios (las cuentas de Mysql que tengas) al "viejo" sistema de gestión de usuarios (contraseñas principalmente) con un pequeño procedimiento (ejecutar ciertas consultas SQL).
Hasta podrían convivir estas dos extensiones (en teoría) y así ir "optimizando" tus aplicaciones que usan Mysql 4.1.x en adelante con PHP 5 y las nuevas librerias mysqli
Un saludo,