Foros del Web » Programando para Internet » Python »

reemplazar caracteres de un string con python

Estas en el tema de reemplazar caracteres de un string con python en el foro de Python en Foros del Web. Hola que tal? necesito reemplazar caracteres de una secuencia, de la siguiente forma: A=T G=C de forma que: si mi secuencia es : AGTCTGA debo ...
  #1 (permalink)  
Antiguo 25/10/2011, 17:40
 
Fecha de Ingreso: octubre-2011
Mensajes: 1
Antigüedad: 12 años, 5 meses
Puntos: 0
reemplazar caracteres de un string con python

Hola que tal? necesito reemplazar caracteres de una secuencia, de la siguiente forma:

A=T
G=C
de forma que:

si mi secuencia es : AGTCTGA

debo obtener la complementaria que seria: TCAGAC

a partir de mi secuencia (AGTCTGA) reemplazo las A por las T, las G por las C, las T por las A y las C por las G.

No se como hacerlo!! alguien que me ayude por favor!!
  #2 (permalink)  
Antiguo 25/10/2011, 19:25
Avatar de razpeitia
Moderador
 
Fecha de Ingreso: marzo-2005
Ubicación: Monterrey, México
Mensajes: 7.321
Antigüedad: 19 años, 1 mes
Puntos: 1360
Respuesta: reemplazar caracteres de un string con python

Tienes que usar maketrans.

Código Python:
Ver original
  1. from string import maketrans
  2. table = maketrans("AGTC", "TCAG")
  3. print "AGTCTGA".translate(table)
  #3 (permalink)  
Antiguo 26/10/2011, 09:23
 
Fecha de Ingreso: enero-2010
Ubicación: Madrid/España
Mensajes: 89
Antigüedad: 14 años, 3 meses
Puntos: 3
Respuesta: reemplazar caracteres de un string con python

Eso me suena a la sintetización de una cadena de adn a proteínas, en concreto, a aminoácidos

Etiquetas: Ninguno
Atención: Estás leyendo un tema que no tiene actividad desde hace más de 6 MESES, te recomendamos abrir un Nuevo tema en lugar de responder al actual.
Respuesta




La zona horaria es GMT -6. Ahora son las 04:25.