mala ordenacion

[azuel]

Hola a todos tengo el siguiente codigo que he conseguido q me ordene por fecha introduciendo los datos en una base de datos pero mi problema es que cuando introduzco nuevos datos le fecha me sale ordenada correctamente (el mas nuevo arriva) pero los archivo no entonces no se a que se puede deber y recalco q esto a sucedido cuando he suvido un archivo nuevo antes funcionava bien.

Código PHP:

  <?php 
$id_ftp=ConectarFTP(); //Obtiene un manejador y se conecta al Servidor FTP 
$ruta=ObtenerRuta(); //Obtiene la ruta actual en el Servidor FTP 
$lista=ftp_nlist($id_ftp,$ruta); //Devuelve un array con los nombres de ficheros 
$contamos = 0; 
$lista=array_reverse($lista); //Invierte orden del array (ordena array) 
while ($item=array_pop($lista)) //Se leen todos los ficheros y directorios del directorio 
{ 
$valor= number_format (((ftp_size($id_ftp,$item))/1024),2)." Kb"; 
if($tamano=="-0.00 Kb") // Si es -0.00 Kb se refiere a un directorio 
{ 
$tamano="&nbsp;"; 
$fecha="&nbsp;"; 
}else{ 
$day=date("Y-m-d", ftp_mdtm($id_ftp,$item)); 
$conexion=mysql_connect("localhost","prueba","passs") or die("Problemas en la conexion"); 
mysql_select_db("Publicidad",$conexion) or die("Problemas en la selección de la base de datos"); 
if ($contamos == 0 ){ 
$contamos++; 
$dos = 'TRUNCATE TABLE `prueba`'; 
mysql_query($dos);  } 
$name=substr($nombre, 24); 
$q="INSERT INTO prueba (nombre,fecha) VALUES ('".$name."','".$day."')"; 
mysql_query($q, $conexion) or die ("problema con query");  
// para tomar algo de la base de datos ...  
$nombre = $item; 
$contamos= $contamos+1; 
} 
   }  
   $contador = 10; 
   $valor = 10; 
$nom_ordenado = array(); 
$fec_ordenado = array(); 
$inicio = "<a target='_self' href='http://link/"; 
$fin="'>"; 
$cierre ="</a>"; 
$rs = mysql_query('SELECT * FROM `prueba` ORDER BY `fecha` DESC ',$conexion); 
while ($fila = mysql_fetch_array($rs)) // recorremos la base de datos 
{ 
for($i=0;$i<=$contamos;$i++) 
{ 
if($fila['nombre']!=""){ 
$nom_ordenado[$i] = $fila['nombre'];  
$fec_ordenado[$i] = $fila['fecha']; 
} 
} 
for($i=0;$i<=0;$i++){ 
 
if ($nom_ordenado[$i] != "" && $fec_ordenado[$i]!= ""){ 
//mostramos los datos   

lo que sigue a continuacion del codigo php es la escritura de las variables
gracias por todo!!

[helacer]

no se si le entendi mal pero lo unico que habria que hacer seria colocar una segunda ordenacion e la sentencia select


'SELECT * FROM `prueba` ORDER BY `fecha` DESC ', `arcnombre` DESC ',