Ayuda PHP con javascript, como hacerlos interactuar?

[nacho004]

Hola muchachos, paso a explicarles mi problema. Me encuentro en un panel de administracion, en la seccion de administracion y visualizacion de usuarios. En esta pagina se me muestra el listado de usuarios. Y arriba de estos coloque en dos selects como filtradores para poder filtrar la busqueda (valga la redundancia).
Estos selects estan con funciones de javascript, lo que use esta aqui: http://www.desarrolloweb.com/articulos/1490.php (es el 2° ejemplo).

Bueno, lo que quiero hacer, es generar un bucle en PHP (consultando la BD) para que en el segundo select aparesca una lista completa con nombres que tengo en la BD. Yo pensaba hacer un bucle para que genere la linea de JS. Un bucle en php como

Código PHP:

  <?
$localidades = "SELECT * FROM localidades";
$i=1;
while($row = mysql_fetch_array($localidades)){
$opcion= 'var academica$i = new Option("Musica del Barroco","Barroco","","");
    combo[$i-1] = academica$i;';
    $i++;
}
?>   

No se como "mezclar" php con js y por esto no puedo realizar esto que les comento.

Desde ya, les agradesco muchisimo!

[ludovico2000]

Los puedes "mezclar" saliendo y entrando del php. Un ejemplo (sobre html, pero sobre javascript es lo mismo):

<?
...cosas php
?>
...cosas html
<input class="contenido" type="text" name="empresa" value="<?=$rs_u->EMPRESA;?>" maxlength="255" size="19"> </td>
...cosas html
<?
...cosas php
?>