Reemplazar varios caracteres a la vez

[laura_moreno14]

Estoy haciendo un pequeño programa que extrae diferentes datos de una secuencia de adn. Supongo que muchos no sabreis de que va eso del ADN pero tampoco tiene mucha importancia para resolver el problema. Me explico.

Yo tengo una secuencia formada solo por A, C, T y G. Por ejemplo:

ACCTGTGGACCTGACCATGGACGGACCCTAGCA

Quiero mediante un script remplazar cada letra de esta manera

A --> T
T --> A
C --> G
G --> C

Soy capaz de remplazar un caracter, por ejemplo las A por T. pero no remplazar todas. El problema es que, como es lógico, cuando remplazo las As por Ts, luego Ts por As, y el resultado es que todas las As y Ts son As.

No se si me explicado bien, necesito de alguna manera realizar todos los cambios en la misma cadena a la vez.

Espero que puedan ayudarme, soy una novata con php, estoy empezando y es el primer problema en el que me quedado realmente atascada.

[neglivv]

Y si pruebas con str_replace? pero pasas un array en lugar de un solo caracter para reemplazar: http://php.net/manual/es/function.str-replace.php

[Ekel]

Código PHP:

  $a = array('A','T','G','C'); 
$b = array('T','A','C','G'); 
$str = 'ACCTGTGGACCTGACCATGGACGGACCCTAGCA' 
echo str_replace($a,$b,$str)  
   

[andresdzphp]

No sirve solo con str_replace, tienes que convertir el string en un array tal vez con str_split (lo recorres con un foreach) y vas comparando si es la letra A concatenas una T y si es una T concatenas una A.

[laura_moreno14]

Ya he probado y tengo el mismo problema

Código PHP:

function convDna ($sec) {
    
    $buscar = array ("A","T","C","G");
    
    $remplazar = array ("T","A","G","C");
    
    $rna = str_replace($buscar,$remplazar,"$sec");
    
 
    echo "$rna";
}
 

En el resultado aparecen solo A y C.

[neglivv]

O puedes hacerlo a "pie"... Hice esto, pero la verdad no sé si entendi tu pregunta:

Código:

$cadena = "ACCTGTGGACCTGACCATGGACGGACCCTAGCA";
/*
A --> T
T --> A
C --> G
G --> C
*/
$max = strlen($cadena);
for ($i=0;$i<$max; $i++){
	if ($cadena[$i] == "A")
		$cadena[$i] = "T";
		
	else if ($cadena[$i] == "T")
		$cadena[$i] = "A";
		
	else if ($cadena[$i] == "C")
		$cadena[$i] = "G";
	
	else if ($cadena[$i] == "G")
		$cadena[$i] = "C";
}

echo $cadena;

[andresdzphp]

Si lo que necesitas es como lo que pone @neglivv bastaría con usar la función strtr

Código PHP:

<?php
 
$str = 'ACCTGTGGACCTGACCATGGACGGACCCTAGCA';
 
$trans = array('A' => 'T', 'T' => 'A', 'G' => 'C', 'C' => 'G');
echo strtr($str, $trans); //TGGACACCTGGACTGGTACCTGCCTGGGATCGT
 

Saludos.

[laura_moreno14]

Gracias, me sirvio de mucho. Tanto el codigo de neglivv como el de andresdzphp funcionan perfectamente , aunque utilizare el ultimo por ser mas corto. Gracias de nuevo!