Problemas con Rutas al crear JAR

[gasoft]

Estoy realizando una Factura utilizando Jasper-Report y su Plugin para Netbeans Ireport.

Para el manejo de los reportes he creado un paquete llamado reportes en el se guardaran el .jasper y el .jxml de cada reporte que realice.
Para "invocar" al reporte utilizo estas líneas de código.

Código:

try
        {
           String master = System.getProperty("user.dir") +"\\src\\reportes\\factura.jasper";

           
            if (master == null)
            {
                System.out.println("No encuentro el archivo del reporte maestro.");
                System.exit(2);
            }

            JasperReport masterReport = null;
            try
            {
                masterReport = (JasperReport) JRLoader.loadObject(master);
                
            }
catch (JRException e)
            {
                System.out.println("Error cargando el reporte maestro: " + e.getMessage());
                System.exit(3);
            }

Funciona perfectamente desde el Entorno de desarrollo ; pero cuando creo el jar, existen problemas con la ruta, ya que el //scr// no queda en el jar.

La Solución que se me ocurre es cuando valla a generar el jar eliminar el //scr// y mientras desarrolle dejarlo; pero pues no es algo muy optimo.. entonces espero me puedan ayudar a solucionar este problemita; saber tal vez como utilizar una ruta relativa que funcione en los dos casos.