Foros del web, para los que viven de bits

Hola, hice una aplicacion con el Jdeveloper que internamente simula en servidor web, pero ahora quiero pasarlo ya todo a tomcat, ya he instalado el tomcat con el jdk y dado de alta todas las variables de ambiente pero...me saca mil errores en todas las compilaciones, no encuentra las clases ni las librerias, aunque las haya declarado en las variables ambientales....
alguna sugerencia??
de antamano gracias!