URL Rewrite de IIS e indexaciones en directorios inexistentes

[hamramr]

Buenos días.
Hemos estado creando muchas reglas en el archivo web.config de nuestra web para reescribir las urls.

Ha sido un proceso tedioso ya que la estructura de la web no es muy organizada. Pero en fin, ahora tenemos un problema con las indexaciones.

Por ejemplo, una url que antes era:

Código:

url/index.php?seccion=a&opcion=b

Ahora la convierte a:

Código:

url/a/b

Y hasta aquí todo perfecto.

Pero el problema es que ahora ha empezado a indexarse páginas como:

Código:

url/a/b/index.php?seccion=c&opcion=d 

Y dichos /a/b/ no son ninguna estructura de directorios... No entiendo qué está pasando.

He leído algo de una condición:

Código:

<add input="{REQUEST_FILENAME}" matchType="IsDirectory" negate="true" />

La he probado pero no veo diferencia, no se si lo estoy haciendo bien.

Muchas gracias por vuestra ayuda.
Un saludo.